Tadashi Usobuki porte un costume noir et est un tueur à gages. Personne ne connaît son passé. Il reçoit des demandes de clients qui sont remplis de désir ou de haine. Il accomplit son travail en utilisant des méthodes comme le pouvoir de suggestion qui rend les meurtres presque impossibles à retracer.
La veille d'une sortie avec le professeur Agasa et les enfants, Conan fait un cauchemar où il voit Gin et Vodka le retrouver et s'en prendre à Ran. Pendant ce temps, une série de meurtres a lieu dans tout le Japon, incitant la police à collaborer entre préfectures. Le seul point commun entre eux est la présence d'une pièce de mah-jong à côté des victimes, ainsi que les derniers mots prononcés par la dernière victime en date : "Tanabata Kyo".
Theo Abram, un sapeur-pompier réputé, a dû prendre sa retraite à la suite d'un choc post-traumatique. Lorsque sa femme est retrouvée morte dans son lit à ses côtés, toutes les forces policières se lancent à ses trousses. Pour sa part, Theo n'a strictement aucun souvenir d'avoir fait ce dont on l'accuse, et tandis qu'il tente de comprendre ce qui s'est réellement passé, il découvre un secret qui devient sa priorité.
Le quartier de Shibuya à Tokyo bat son plein pour la saison d'Halloween. La détective Miwako Sato est en robe de mariée devant un parterre d’invités, dont Conan bien sûr ! Soudain, un agresseur fait irruption dans la salle de réception et le détective Wataru Takagi, est blessé en tentant de protéger Sato. L’image de la Faucheuse qu’elle avait alors vue au-dessus du détective Matsuda plane désormais sur Takagi. Au même moment, voilà que l'auteur de l’explosion responsable de la mort de Matsuda s'évade de prison. Piégé par une mystérieuse personne déguisée, le détective Rei Furuya se retrouve avec une bombe autour du cou. Conan le retrouve dans l'abri souterrain où il se cache pour essayer de désarmer la bombe et là, ce dernier lui raconte les détails d'un incident ayant impliqué ses camarades de classe de l'académie de police : 3 ans plus tôt, ils ont rencontré un poseur de bombes nommé «Plamya» à Shibuya.
Un espion vole des dossiers secrets provenant de divers services de renseignements comme le MI6, la BND ou la CIA à la police japonaise. Durant sa fuite, il subit un accident de voiture provoqué un tir de carabine de Shuichi Akai. Le lendemain, une jolie jeune femme blessée et seule est trouvé par Conan et ses amis à un aquarium à Tokyo. Ces derniers décident alors de l'aider à retrouver sa mémoire. La scène est observée par Vermouth
Dans le Japon d'après-guerre, un policier se fait subtiliser son arme. Son supérieur refuse sa démission et l'envoie à la poursuite du malfaiteur. Il mène son enquête dans les bas-fonds de Tokyo, où il côtoie la misère d'une population qui survit difficilement à la défaite de son pays.
Appelé en pleine nuit à soigner un jeune gangster pour une blessure à la main, un médecin alcoolique décèle une affection plus grave, la tuberculose. Il tente de soigner le jeune homme qui ne veut rien entendre, et malgré les disputes et les menaces, il se prend d'amitié pour lui. Le chassé-croisé des deux hommes que tout oppose trouvera une issue tragique dans les milieux violents de la pègre japonaise.
Après des années d'absence, Jeff Sanders, spécialiste en arts martiaux depuis l'adolescence, retrouve son ami d'enfance Kim. En tentant d'échapper au mafieux coréen Yun, Kim est assassiné. Jeff, aveuglé par la mort de son ami, se lance dans une terrible et interminable vengeance que seul son frère Adam, policier, pourra tenter d’arrêter.
L'oncle de Sonoko Suzuki, Jirokichi, a invité Conan et ses amis dans le plus grand dirigeable au monde, le Bell Tree, où se trouve un diamant d'une valeur inestimable. Tout ceci n'est que ruse afin de pouvoir enfin capturer le célèbre Kaito Kid. Mais de mystérieux terroristes armés jusqu'aux dents font irruption, et injecteront un virus mortel dans le dirigeable si leurs requêtes se sont pas satisfaites. Conan et ses amis sont piégés, commence alors une bataille pour survivre ! Pourront-ils sortir de cette situation ?
L'entourage de Kogoro Mouri est en danger ! Un ancien détenu, que notre détective a mis sous les verrous dans le passé, ressurgit et s'attaque aux proches de Mouri en commençant par l'inspecteur Megure et le professeur Agasa. Shinichi Kudo, alias Conan Edogawa, va devoir faire de tout son possible pour éviter toute victime et mettre rapidement un terme aux agissements de ce meurtrier. Parallèlement, Ran apprendra la raison pour laquelle son père a quitté la police et sa femme : Eri Kisaki.
Goku est un privé spécialisé dans les adultères. Un jour, il apprend le suicide d'un ex-associé. Intrigué, il apprend que ce décès pourrait être l'oeuvre d'un trafiquant d'armes nommé Hakuro. Devant l'inefficacité de la police, il décide de prendre l'enquête en main.
Dans une réalité uchronique, la Seconde Guerre Mondiale n'a jamais eu lieu, mais la crise économique aura creusé les différences sociales au Japon. Dans un état régi par les riches prolétaires, un mystérieux voleur masqué se joue des puissantes forces de la loi en enchaînant les vols les plus audacieux. Dans le camp des pauvres, le talentueux artiste de cirque Heikichi Endo est approché par un journaliste pour lui servir de paparazzi pour tenter de voler des clichés au prochain mariage en huis-clos entre le chef de la police et une riche héritière. Trop tard, le jeune homme se rend-il compte, qu'il est la victime d'un mystérieux complot le visant à endosser l'habit du mystérieux voleur K-20…Après avoir été secouru par les siens, il tente de faire tout l'éclairage sur l'affaire en se transformant lui-même en justicier…
Pour avoir décoché un coup de poing à un yakuza énervé par sa lenteur, Masaki, jeune pompiste quelque peu hébété, se retrouve dans une situation délicate. Effrayé par les conséquences de son acte et les menaces de destruction qui planent sur la station-service, il demande de l'aide à l'entraîneur des Eagles, l'équipe amateure de base-ball dans laquelle il joue. Ce dernier, lui-même ancien yakuza se fait vertement recevoir et humilier par le chef du gang. Livré à lui-même, Masaki part pour Okinawa avec Kazuo, un de ses coéquipiers, à la recherche d'une arme pour se protéger.
Pendant un discours du père de Sonoko, le Kid fait son apparition, pour, cette fois, voler le tableau : Les Tournesols des flammes. Suivant cette apparition en direct, Conan et les détectives boys partent à sa rencontre. Pendant qu'ils sont chez Sonoko, avec le Kid déguisé en Shinichi, le manoir prend feu...
Joe Barrett revient à Tokyo après la Seconde Guerre mondiale où il a autrefois appartenu à un bar, Tokyo Joe, et abandonné sa femme Trina. Ils ont une fille âgée de sept ans. force Kimura Joe en pilotant les criminels de guerre en révélant que pendant la guerre Trina a fait des émissions de propagande traîtresses.
L'action se passe à Tokyo, l'histoire d'un policier, Eddie Kenner, s'infiltrant au sein d'un gang brutal d'anciens G.I. mené par Sandy Dawson, afin de retrouver les assassins d'une victime tuée au cours d'un hold-up d'un train de munitions. Sandy sauve la vie au policier et fait de lui son préféré, remplaçant Griff (tué par Sandy). Mais il s'apercevra de la traîtrise d'Eddy ; lors du règlement de comptes final Eddy tue Sandy.
Au début des années 40, quelque part aux Etats-Unis. Les élections locales approchent. Paul Madvig, politicien arrogant et sans scrupules, se fait gifler en public par Janet, la fille de Ralph Henry, l'un de ses rivaux. Piqué au vif, il change ses plans, lâche son ancien allié, le gangster Nick Varna, et prend contact avec Ralph Henry, à qui il propose une association. Il espère faire d'une pierre deux coups : remporter les élections et séduire Janet, qu'il aime en vain. Mais voilà que le fils de Henry est retrouvé mort, assassiné. Madvig est rapidement soupçonné..
Un ex-détective devenu professeur en criminologie s’installe avec son épouse dans un nouveau quartier, à la recherche d’une vie tranquille. Alors qu’on lui demande de participer à une enquête à propos de disparitions, sa femme fait la connaissance de leurs étranges voisins.
Le reporter Frank Ross dénonce dans la presse les agissements d'un homme corrompu, candidat aux élections, le district attorney Jesse Hanley. Ce dernier envoie ses hommes de main pour neutraliser Frank. Victime d'un coup monté, celui-ci se retrouve en prison où il se lie d'amitié avec un caïd, Hood Stacey, qui va l'aider à faire éclater la vérité.
Conan Edogawa entreprend d'appréhender Lupin III, le suspect du vol d'un bijou appelé Cherry Sapphire. (Une suite de l'émission spéciale Lupin le troisième contre le détective Conan, 2009).
