Willy est une orque mâle, capturée puis vendue à un centre aquatique pour y être dressée et exploitée. Jesse, préadolescent abandonné par sa mère, rebelle à l'autorité et fugueur, est arrêté pour vandalisme au cours d'une fugue et placé dans une famille d'accueil qui désire l'adopter. Il doit nettoyer ses graffitis au centre aquatique et y fait la rencontre de Willy qui devient peu à peu son meilleur ami. Mais puisque l'orque ne coopère pas au spectacle qu'on attend de lui, elle manque de se faire tuer sur ordre du peu scrupuleux propriétaire des lieux. Jesse et ses nouveaux amis décident de l'aider à regagner la mer et la liberté.
Jesse est maintenant devenu un adolescent, tandis que l'orque Willy a fondé sa propre bande et coule des jours heureux le long de la côte nord-ouest du Pacifique. Menacé par des chasseurs, Willy pourra une fois encore compter sur l'amitié de Jesse et l'aide de Max, le fils de l'un de ces chasseurs pour échaper aux dangers qui planent sur lui et sa bande.
Jason James Richter
Jesse
Michael Madsen
Glen Greenwood
Jayne Atkinson
Annie Greenwood
August Schellenberg
Randolph Johnson
Mary Kate Schellhardt
Nadine
Francis Capra
Elvis
Mykelti Williamson
Dwight Mercer
Elizabeth Peña
Kate Haley
Jon Tenney
John Milner
M. Emmet Walsh
Bill Wilcox
Paul Tuerpe
Milner's Assistant
John Considine
Commander Blake